Der im westlichen Hermopolis verehrte Thot war ein Mondgott. Aus diesem Grund wählte wohl Pharao Echnaton das gegenüberliegende Ostufer als Kultort für seinen neukreierten Sonnengott Aton und nannte die Stadt Achet-Aton („Das Lichtland des Aton“). Wichtig war ihm wohl auch, dass dieser Ort auf ungefähr halber Strecke zwischen den beiden damaligen Hauptstädten Ägyptens lag: der administrativen Memphis und der religiösen Theben. Beide Aufgaben verlegte er in seine neue Hauptstadt Amarna. Nach dem Tod und der dortigen Bestattung der königlichen Familie Echnatons wurde die Stadt schnell aufgegeben und ihr Baumaterial zur Erweiterung des Thot-Tempels in Hermopolis wiederverwendet.
